（1）交易客观性的优势
系统化交易具有客观性，可排除人为贪婪及恐惧等因素。程序化交易系统以计算机为决策工具，从而有效解决了交易者的情绪对交易的负面影响这个问题。
人们在参与交易时，随着盈利或亏损的变化，难免会受到一些负面情绪的影响。如盈利的贪婪，或者暂时亏损时的恐惧等。这些情绪会影响交易者做出不理性的决策，从而与盈利失之交臂，而有时候抓住这样的机会也许只需要再坚持几分钟或者几小时。而程序化交易能代替人们时刻保持“头脑清醒”。
（2）速度优势
由于市场价格波动快，对于金融衍生产品重仓操作每天都有可能让交易者承受过重的心理压力。程序化交易可以让交易者迅速换手。同时日内短线交易者对速度的要求也非常严格。而程序化交易能够自动触发成交。所以毫无疑问的和个人实际的交易行动相比较，这在速度上给交易者带来了全新的不同，也让普通的散户投资者在这个层面上和职业化的交易者和大机构站在了同等的舞台上面。如当发现了RSI指标顶背离等一些投资机会时，程序化交易能在第一时间下单，自动抓取每一个敏感而细小的盈利机会。
（3）计算能力的优势
金融衍生品交易中往往会遇到许多复杂的模型，要计算如此复杂的模型，对计算能力有很高的要求，程序化交易在计算机的帮助下能实现对定价进行估算、快速寻找不同投资品种之间的价差或者是对历史数据进行统计分析，寻找合理的买点与卖点等等。并且能通过反复模拟测试收益率，比较不同的投资策略，从而选出最优的投资策略。这些在组合金融衍生品指标交易、股指期货期现套利等方面发挥出巨大优势。
（4）分散投资风险的优势
因为无法保证每一笔交易的盈利，金融衍生品市场的交易很大程度上是博取概率事件的胜率。因此，这就需要我们分散我们的交易，同时对多个品种交易，或者同时采用不同的交易策略对一个品种交易。采用程序化交易可以顺利完成上述策略，达到最大限度的风险分散，实现合理资产配置。
（5）持续关注市场的优势
程序化交易能持续关注全球市场变化，因而能持续快速发现市场的投资机会。例如一个程序化交易策略可以同时追踪所有国内期货品种的RSI指标背离、股指期货期现套利机会，并给出预警信号。从另外一个角度来说，在程序化交易的帮助下，投资者可以将有限的精力放在做一些重大决策上，大大降低投资的人力成本。